Nach Tätigkeit als Posaunist im Sinfonieorchester des Stadttheaters Freiburg i. Br. und in mehreren Jazzformationen wandte er sich der alemannischen Volksmusik zu und gründete die Musikgruppe „Gälfiäßler“, die mit historischen und kuriosen selbstgebauten Instrumenten als Gruppe mit den meisten Musikinstrumenten (152) ins Guinnessbuch der Rekorde eingetragen wurde. Für sein Engagement für die heimische Volksmusik erhielt er 2012 die Heimatmedaille des Landes Baden-Württemberg.

Ab dem Jahr 2009 wirkte er mit Alp- und Naturhörnern im Weltmusikorchester von Rüdiger Oppermann mit und lernte dort den mongolischen Musiker Enkhjargal Dandarvaanchig (Epi) kennen. Mit diesem und dem Senegalesen Pape Dieye gründete er das Weltmusiktrio Frapapepi. Als Solist und mit diesem Trio konzertiert er international, gibt Kurse und Einzelunterricht und baut und vertreibt Alphörner. Seine Sammlung von Alp- und Naturhörnern aus der ganzen Welt ist in namhaften Museen unterwegs.

Franz Schüssele ist als Dozent für Posaune an der PH Freiburg und als Dozent für Alphorn am „Center for World Music“ der Universität Hildesheim tätig. Im Jahr 2017 wurde er als erster Deutscher zu einem Vortrag über Alphörner an eine Schweizer Universität (Luzern) eingeladen.

Als „schreibender“ Musiker veröffentlichte er etliche Fachbücher, u.a. das heute leider vergriffene Standardwerk „Alp- und Hirtenhorn in Europa“. Als Fortführung dieses Buches erscheint im Jahr 2023 der Band „Alphorn  Co – Naturinstrumente der Welt“.